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Las manifestaciones derivadas de la exposición a este patógeno son de entidad variable y van desde infecciones leves del tracto respiratorio superior (resfriados, faringitis, etc.) hasta formas más graves de neumonía.
los Mycoplasma pneumoniae asume relevancia clínica sobre todo por ser la principal causa de neumonía atípica primaria. Esta enfermedad afecta principalmente a niños y adultos jóvenes, en un grupo de edad de entre 5 y 35 años La neumonía atípica primaria suele ser asintomática, pero, cuando las defensas inmunitarias están reducidas, la infección puede dar lugar a complicaciones hematológicas y neurológicas muy graves.
se sabe que es el agente causante más común de neumonía atípica primaria.