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Más específicamente, el término se utiliza para indicar la ocupación del espacio de las criptas (es decir, cavidades) presentes en la superficie de las glándulas amigdalares, por detritos infecciosos, depósitos de material calcificado o residuos de alimentos.
Las amígdalas crípticas se asocian con la aparición de placas blanquecinas y malolientes, mal aliento (halitosis), dolor de oído, dolor de garganta, problemas para tragar y amígdalas hipertróficas.
Cuando los sedimentos de alimentos o de otra naturaleza ocupan el espacio de las criptas amigdalares y se asientan de forma permanente, pueden dar lugar a una serie de molestias que deben corregirse con prontitud con el tratamiento adecuado.
En este sentido, una "cuidadosa evaluación clínica por parte del otorrinolaringólogo" permite identificar las causas exactas del trastorno y establecer las estrategias terapéuticas más adecuadas. Si las amígdalas crípticas son la causa de infecciones recurrentes graves y resistentes al tratamiento farmacológico, se indica su extirpación (amigdalectomía).